Al obtener la Copa Argentina, Boca consiguió una plaza en la Copa Sudamericana, torneo que hacía 3 años que no jugaba. En primera instancia su rival es otro club argentino: Independiente. Empató los dos encuentros, pero como recibió goles de local y no pudo marcarlos de visitante, quedó afuera. San Pablo fue el campeón
| Día | Partido | Resultado | Estadio | C | |
|---|---|---|---|---|---|
| 22/08/2012 | Dieciseisavos de Final. Partido de Ida | Boca 3 - Independiente 3
 22/08/2012 |
Boca Juniors | L | |
| 29/08/2012 | Dieciseisavos de Final. Partido de Vuelta | Independiente 0 - Boca 0
 29/08/2012 |
Independiente | V |
Boca ganó: 0 (0.00%)
Empató: 2 (100.00%)
Perdió: 0 (0.00%)
Goles convertidos: 3 (1.50)
Goles recibidos: 3 (1.50)
Total Partidos: 2 (33.33%)
✓ Triunfo = Empate ✕ Derrota
| 5 |
Sánchez Miño, Juan Manuel
 Partidos jugados por Juan Manuel Sánchez Miño en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 1 | 0 |
| 19 |
Silva, Santiago Martín
 Partidos jugados por Santiago Martín Silva en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 1 | 0 |
| 18 |
Somoza, Leandro Daniel
 Partidos jugados por Leandro Daniel Somoza en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 1 | 0 |
| 7 |
Acosta, Lautaro Germán
 Partidos jugados por Lautaro Germán Acosta en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 0 | 0 |
| 13 |
Albín, Emiliano
 Partidos jugados por Emiliano Albín en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 0 | 0 |
| 20 |
Burdisso, Guillermo Enio
 Partidos jugados por Guillermo Enio Burdisso en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 0 | 0 |
| 14 |
Cellay, Christian Ariel
 Partidos jugados por Christian Ariel Cellay en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 0 | 0 |
| 21 |
Chávez, Cristian Manuel
 Partidos jugados por Cristian Manuel Chávez en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 0 | 0 |
| 16 |
Ledesma, Pablo Martín
 Partidos jugados por Pablo Martín Ledesma en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 0 | 0 |
| 3 |
Rodríguez, Clemente Juan
 Partidos jugados por Clemente Juan Rodríguez en Copa Sudamericana 2012 |
2 | 0 | 0 |
| 17 |
Blandi, Nicolás
 Partidos jugados por Nicolás Blandi en Copa Sudamericana 2012 |
1 | 0 | 1 |
| 12 |
D´Angelo, Sebastián
 Partidos jugados por Sebastián D´Angelo en Copa Sudamericana 2012 |
1 | 0 | 1 |
| 10 |
Paredes, Leandro Daniel
 Partidos jugados por Leandro Daniel Paredes en Copa Sudamericana 2012 |
1 | 0 | 1 |
| 2 |
Schiavi, Rolando Carlos
 Partidos jugados por Rolando Carlos Schiavi en Copa Sudamericana 2012 |
1 | 0 | 0 |
| 23 |
Ustari, Oscar
 Partidos jugados por Oscar Ustari en Copa Sudamericana 2012 |
1 | 0 | 0 |
| 9 |
Viatri, Lucas Ezequiel
 Partidos jugados por Lucas Ezequiel Viatri en Copa Sudamericana 2012 |
1 | 0 | 0 |
Jugadores utilizados: 16
| 15 |
Colazo, Nicolás Carlos
 Suplencias sin ingresar de Nicolás Carlos Colazo en Copa Sudamericana 2012 |
2 |
| 8 |
Rivero, Diego Alejandro
 Suplencias sin ingresar de Diego Alejandro Rivero en Copa Sudamericana 2012 |
2 |
| 27 |
Gaona Lugo, Orlando Gabriel
 Suplencias sin ingresar de Orlando Gabriel Gaona Lugo en Copa Sudamericana 2012 |
1 |
| 24 |
Magallán, Lisandro
 Suplencias sin ingresar de Lisandro Magallán en Copa Sudamericana 2012 |
1 |
| 25 |
Vicentini, Manuel
 Suplencias sin ingresar de Manuel Vicentini en Copa Sudamericana 2012 |
1 |
Suplentes que no entraron: 5
| Director Técnico | Partidos |
|---|---|
Falcioni, Julio César
 Partidos dirigidos por Julio César Falcioni en Copa Sudamericana 2012 |
2 |
Asistente Historia de Boca